Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
SUPT5HO00267 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
SUPT5HO00267 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
SUPT5HO00267 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
SUPT5HO00267 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC46.67■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC46.66■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
SUPT5HO00267 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
SUPT5HO00267 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC46.57■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC46.53■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.52■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
SUPT5HO00267 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC46.45■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
SUPT5HO00267 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.43■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC46.4■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.02
SUPT5HO00267 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC46.33■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
SUPT5HO00267 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC46.31■■■■■ 5
SUPT5HO00267 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
SUPT5HO00267 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
SUPT5HO00267 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC46.29■■■■■ 5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms