Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3B1O00203 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B1O00203 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B1O00203 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3B1O00203 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3B1O00203 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms