Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3QKU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3QKU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3QKU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3QKU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3QKU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QKU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QKU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QKU1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QKU1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QKU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3QKU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3QKU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QKU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QKU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QKU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QKU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QKU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3QKU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3QKU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3QKU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
J3QKU1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3QKU1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3QKU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3QKU1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3QKU1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3QKU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3QKU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3QKU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3QKU1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3QKU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3QKU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3QKU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3QKU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3QKU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
J3QKU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3QKU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3QKU1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QKU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QKU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QKU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QKU1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3QKU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3QKU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3QKU1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3QKU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3QKU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3QKU1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3QKU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
J3QKU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3QKU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3QKU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3QKU1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3QKU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3QKU1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QKU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QKU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QKU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3QKU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3QKU1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QKU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QKU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QKU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QKU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QKU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QKU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3QKU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3QKU1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3QKU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3QKU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3QKU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3QKU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
J3QKU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
J3QKU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3QKU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
J3QKU1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3QKU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3QKU1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
J3QKU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3QKU1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
J3QKU1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QKU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QKU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QKU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
J3QKU1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3QKU1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
J3QKU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3QKU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3QKU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3QKU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
J3QKU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QKU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QKU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QKU1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
J3QKU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3QKU1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3QKU1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
J3QKU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
J3QKU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
J3QKU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms