Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
H7C1D1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
H7C1D1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
H7C1D1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
H7C1D1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
H7C1D1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
H7C1D1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1D1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1D1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1D1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1D1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
H7C1D1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
H7C1D1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
H7C1D1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
H7C1D1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
H7C1D1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
H7C1D1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
H7C1D1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
H7C1D1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
H7C1D1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
H7C1D1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
H7C1D1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
H7C1D1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
H7C1D1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
H7C1D1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
H7C1D1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
H7C1D1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
H7C1D1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
H7C1D1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
H7C1D1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1D1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1D1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1D1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
H7C1D1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1D1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1D1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1D1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
H7C1D1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
H7C1D1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
H7C1D1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
H7C1D1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
H7C1D1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
H7C1D1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
H7C1D1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
H7C1D1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
H7C1D1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
H7C1D1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
H7C1D1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
H7C1D1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
H7C1D1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
H7C1D1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
H7C1D1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
H7C1D1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
H7C1D1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
H7C1D1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
H7C1D1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
H7C1D1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
H7C1D1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1D1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1D1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1D1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
H7C1D1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
H7C1D1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
H7C1D1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
H7C1D1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
H7C1D1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
H7C1D1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
H7C1D1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1D1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1D1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
H7C1D1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
H7C1D1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
H7C1D1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
H7C1D1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
H7C1D1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
H7C1D1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
H7C1D1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
H7C1D1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
H7C1D1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
H7C1D1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
H7C1D1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1D1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
H7C1D1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
H7C1D1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
H7C1D1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
H7C1D1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
H7C1D1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
H7C1D1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
H7C1D1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
H7C1D1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
H7C1D1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
H7C1D1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
H7C1D1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
H7C1D1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
H7C1D1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
H7C1D1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1D1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1D1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1D1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
H7C1D1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms