Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms