Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LH3BP13 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LH3BP13 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2LH3BP13 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2LH3BP13 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2LH3BP13 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2LH3BP13 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms