Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPB6E9PJ23 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB6E9PJ23 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NPIPB6E9PJ23 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NPIPB6E9PJ23 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms