Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPA2E9PIF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPA2E9PIF3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPIPA2E9PIF3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPA2E9PIF3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms