Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9J4A7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9J4A7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9J4A7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9J4A7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C9J4A7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9J4A7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9J4A7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9J4A7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9J4A7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9J4A7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9J4A7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9J4A7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9J4A7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9J4A7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9J4A7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9J4A7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9J4A7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9J4A7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9J4A7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9J4A7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9J4A7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9J4A7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9J4A7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9J4A7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9J4A7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9J4A7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9J4A7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9J4A7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9J4A7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9J4A7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9J4A7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C9J4A7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9J4A7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9J4A7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9J4A7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9J4A7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9J4A7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9J4A7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9J4A7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9J4A7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9J4A7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C9J4A7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9J4A7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9J4A7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9J4A7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9J4A7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9J4A7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9J4A7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9J4A7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9J4A7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9J4A7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9J4A7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9J4A7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9J4A7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9J4A7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9J4A7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9J4A7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9J4A7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9J4A7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9J4A7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9J4A7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9J4A7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9J4A7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9J4A7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9J4A7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C9J4A7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9J4A7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9J4A7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C9J4A7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9J4A7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9J4A7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9J4A7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9J4A7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9J4A7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9J4A7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C9J4A7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9J4A7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9J4A7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9J4A7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9J4A7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9J4A7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9J4A7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9J4A7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9J4A7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9J4A7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms