Protein–RNA interactions for Protein: A8MTB9

CEACAM18, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM18A8MTB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM18A8MTB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEACAM18A8MTB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM18A8MTB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM18A8MTB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM18A8MTB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms