Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC169A6NNP5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC169A6NNP5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC169A6NNP5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC169A6NNP5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms