Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85CA6NKD9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85CA6NKD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85CA6NKD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85CA6NKD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85CA6NKD9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC85CA6NKD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85CA6NKD9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC85CA6NKD9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC85CA6NKD9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC85CA6NKD9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC85CA6NKD9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC85CA6NKD9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms