Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPOPA6NHQ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPOPA6NHQ4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPOPA6NHQ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPOPA6NHQ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPOPA6NHQ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms