Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF27A3QJZ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF27A3QJZ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF27A3QJZ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF27A3QJZ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF27A3QJZ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF27A3QJZ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF27A3QJZ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms