Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SBNO1A3KN83 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SBNO1A3KN83 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SBNO1A3KN83 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SBNO1A3KN83 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SBNO1A3KN83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SBNO1A3KN83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SBNO1A3KN83 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SBNO1A3KN83 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SBNO1A3KN83 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SBNO1A3KN83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SBNO1A3KN83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SBNO1A3KN83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
SBNO1A3KN83 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SBNO1A3KN83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SBNO1A3KN83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SBNO1A3KN83 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms