Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM72A0PK05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM72A0PK05 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM72A0PK05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM72A0PK05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM72A0PK05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM72A0PK05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM72A0PK05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms