Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM129A0AVI4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM129A0AVI4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM129A0AVI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM129A0AVI4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms