Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PHACTR3-201ENST00000355648 2247 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF19-201ENST00000248484 3276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC011330.1-201ENST00000510070 3235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 THG1L-201ENST00000231198 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL353132.1-201ENST00000415260 2043 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LRP2-202ENST00000443831 4007 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PAPD4-207ENST00000504233 2997 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC6A16-201ENST00000335875 2938 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CLCN3P1-202ENST00000609203 1944 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ARHGEF39-201ENST00000378387 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HEPACAM2-204ENST00000453812 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HERC2P8-202ENST00000564334 3705 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF648-201ENST00000339948 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF2-203ENST00000614034 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC021491.4-201ENST00000620769 2573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF11B-201ENST00000297350 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF585A-203ENST00000392157 3190 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01721-201ENST00000457274 2376 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ELOA2-201ENST00000332567 3050 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ALKBH8-206ENST00000429370 2296 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ERICH3-201ENST00000326665 7159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OR10K1-205ENST00000641535 2124 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PARD3B-202ENST00000351153 3411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PARD3B-203ENST00000358768 3432 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 WDPCP-201ENST00000272321 3392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NFKB1-212ENST00000600343 4010 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms