Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 USP17L17-202ENST00000614762 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 USP17L19-202ENST00000615989 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 USP17L13-202ENST00000616303 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 USP17L18-202ENST00000619296 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 USP17L15-202ENST00000621432 1680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 USP17L25-202ENST00000621472 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 USP17L22-202ENST00000622009 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 USP17L24-202ENST00000622713 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 SAXO2-201ENST00000339465 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 C7orf71-201ENST00000409974 1956 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 OPTN-205ENST00000378757 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ZNF610-203ENST00000403906 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 SMIM7-208ENST00000487416 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ABCB4-206ENST00000453593 3699 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC005176.1-201ENST00000594263 1831 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 NBPF19-202ENST00000426482 2344 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 SLAMF7-206ENST00000458104 2345 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 UNC5D-205ENST00000449677 2448 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ALDH7A1-227ENST00000636879 2501 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 KCND1-202ENST00000376477 3306 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 PPP3CB-202ENST00000360663 3501 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 SEZ6L2-201ENST00000308713 3801 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 GHR-212ENST00000620156 4529 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 NOS2-201ENST00000313735 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 RAET1E-207ENST00000532335 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 DYNLRB1-201ENST00000300469 1464 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 APLF-202ENST00000394342 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 MITF-205ENST00000394348 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC244034.1-201ENST00000428027 792 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC244205.2-201ENST00000434790 898 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 IFNWP5-201ENST00000445100 588 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC078845.1-201ENST00000445293 889 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 LINC01937-201ENST00000448543 553 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 PRPS1L1-201ENST00000506618 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC087521.2-203ENST00000530450 593 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC078962.2-201ENST00000541885 712 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 EIF4A1P9-201ENST00000576035 1207 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC243772.3-202ENST00000609662 1148 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC245505.3-201ENST00000616788 358 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 C22orf24-203ENST00000623735 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 CCDC25-201ENST00000356537 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 RPGR-201ENST00000318842 3108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 TMEM150C-204ENST00000515780 3296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AL162632.3-201ENST00000566976 1625 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 PMS2CL-204ENST00000486256 3327 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 CYB561A3-221ENST00000546151 3986 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 AC022182.3-201ENST00000529239 2167 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 TBC1D22A-AS1-202ENST00000640274 1951 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 SERPINB8-202ENST00000353706 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZBED2Q9BTP6 TBCA-201ENST00000306388 2301 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms