Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
COL4A6Q14031 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms