Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LYVE1Q9Y5Y7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYVE1Q9Y5Y7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms