Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFG3L2Q9Y4W6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFG3L2Q9Y4W6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms