Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms