Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms