Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNEQ9Y223 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms