Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms