Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms