Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FBXO4Q9UKT5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FBXO4Q9UKT5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms