Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBE1Q9UJT0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms