Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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RABGEF1Q9UJ41 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABGEF1Q9UJ41 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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