Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP25Q9UHP3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms