Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACFD1Q9UGQ2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms