Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms