Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL9Q9P2J3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms