Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L2Q9P2F8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L2Q9P2F8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L2Q9P2F8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L2Q9P2F8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L2Q9P2F8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms