Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms