Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNKQ9P0W0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNKQ9P0W0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms