Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMOD2Q9NZR1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMOD2Q9NZR1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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