Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC25Q9NXE8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC25Q9NXE8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms