Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF1DQ9H5J8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms