Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms