Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC113Q9H0I3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms