Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF541Q9H0D2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF541Q9H0D2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms