Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP2-2Q9BYT5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP2-2Q9BYT5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms