Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms