Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PBDC1Q9BVG4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBDC1Q9BVG4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms