Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCK3Q9BQ16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms