Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC17Q96LX7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC17Q96LX7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms