Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD3Q96L08 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms