Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EAF1Q96JC9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms